TruSight Tumor 170ВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSight Tumor 170

Комплексная NGS-панель, которая нацелена на варианты ДНК и РНК из одного и того же образца FFPE.

TruSight Tumor 170 разработана для покрытия 170 генов, связанных с известными солидными опухолями, представляет собой таргетную панель на основе обогащения, которая одновременно анализирует ДНК и РНК, охватывая широкий спектр генов и разных вариантов. Всесторонний характер предоставляет лабораториям глубокое понимание генетики рака.

Обширное покрытие связанных с раком вариантов

Оценка фьюженов, вариантов сплайсинга, инсерций / делеций и однонуклеотидных вариантов (SNV), и амплификации в одной панеле с использованием ДНК и РНК позволяет повысить эффективность использования образца, времени и стоимости.


Достоверные результаты из образцов низкого качества

Обнаружение вариантов с частотой мутантных аллелей всего лишь 5% с использованием всего лишь 40 нг ДНК и РНК максимизирует результаты из драгоценных образцов FFPE.

Интегрированный, оптимизированный рабочий процесс

После стадии фрагментирования ДНК/синтеза кДНК пробоподготовка ДНК и РНК образцов происходит параллельно по объединённому рабочему протоколу.

Спецификации

Время эксперимента
~ 2 дня (подготовка библиотеки)
Время непосредственно ручной работы
~ 10,5 часов
Количество стартового материала 40 нг ДНК и / или РНК
Тип рака Солидная Опухоль
Описание Выполните обширное исследование обнаружения соматического варианта в солидных опухолях, используя информацию об определении вариантов из ДНК и РНК.
Особенности содержимого Обогащение зондами кодирующих последовательностей 170 генов. Определение однонуклеотидных вариантов, малых вставок и делеций в 151 гене, амплификаций в 59 генах, фьюженов и вариантов сплайсинга в 55 генах.
 Мультиплексирование До 32-plex для ДНК с использованием обоих наборов индексов, до 16-plex для РНК
Для работы с какими платформами подходит HiSeq 2500, NextSeq 500, NextSeq 550
Класс вариантов Варианты числа копий (CNV), фьюжены генов, инделы (вставки-делеции), однонуклеотидный полиморфизм (SNP), соматические варианты, структурные варианты.
Тип нуклеиновой кислоты РНК, ДНК
Специализированные типы образцов FFPE-ткани; малое количество стартового материала
Метод Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование, Таргетное РНК секвенирование
Для исследования каких видов подходит Человек
Технология Секвенирование

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
NextSeq 550             Образцов за запуск (high output): 16 (8 ДНК + 8 РНК), 10, если только ДНК, 16, если только РНК
2 × 101 п.о.(рекомендуемый максимум)
HiSeq 2500         Образцов за запуск (rapid run): 12 (6 ДНК + 6 РНК), 6, если только ДНК, 12, если только РНК 2 × 101 п.о.(рекомендуемый максимум)