AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 ― это таргетная панель для изучения хотспотов 50 известных генов, ассоциируемых с раком, в соответствии с базой данных «Каталога соматических раковых мутаций» (COSMIC). Основные характеристики:
Содержимое набора
Таргеты ~2800 COSMIC мутаций из 50 онкогенов и генов-супрессоров опухолей.
Быстрый, оптимизированный рабочий процесс
Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE
Точные данные
Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis
Панель Cancer HotSpot является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.
Эта панель позволяет обнаруживать вариации в нескольких типах рака, включая раки легких, толстой кишки, молочной железы, яичников, меланомы и простаты. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.
Спецификации
Число ампликонов |
всего 207, 1 пул |
---|---|
Время анализа |
5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) |
Время ручного труда |
<1,5 часов |
Тип нуклеиновой кислоты | ДНК |
Количество стартового материала | 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул) |
Особенности содержимого |
хотспоты 50 генов с известными ассоциациями с раком |
Multiplexing | 96 dual index combinations |
Механизм действия | Мультиплексная ПЦР |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
Класс вариаций |
Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants |
Для работы с какими платформами подходит |
iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме) |
Специальные типы образцов | кровь, FFPE |
Технология | Секвенирование |