TruSight Oncology 500 ctDNA
TruSight Oncology 500 ctDNA - панель, нацеленная на исследование множественных соматических вариантов, включая мутационную нагрузку опухоли (TMB) и микросателлитную нестабильность (MSI), из образцов из плазмы.
TruSight Oncology 500 ctDNA
Панель, нацеленная на исследование множественных соматических вариантов, включая мутационную нагрузку опухоли (TMB) и микросателлитную нестабильность (MSI), из образцов из плазмы.
Эта NGS-панель позволяет провести комплексное геномное профилирование опухоли на основе свободноциркулирующей ДНК (cfDNA) и оценивает множественные варианты в 523 генах, связанных с раком.
Комплексное геномное профилирование образцов из плазмы
То же содержание, что и в TruSight Oncology 500, для обнаружения однонуклеотидных вариантов (SNV), инделов, CNV, фьюженов ДНК, TMB и MSI
Быстрое и точное обнаружение вариантов
Усовершенствованный алгоритм определения вариантов, усиленный и ускоренный DRAGEN
Уверенность в результатах
Химия гибридного захвата, UMI и значительная глубина покрытия, а также тщательно продуманная коррекция ошибок улучшают определение вариантов и уменьшает случайные эффекты
Мощность секвенатора NovaSeq 6000
Анализ cfDNA с необходимой мощностью секвенирования для обнаружения редких вариантов в плазме
Спецификации
Тип нуклеиновой кислоты | ДНК |
---|---|
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Тип рака |
Пан-раковый анализ |
Метод |
Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование |
Класс вариантов |
Варианты числа копий (CNV), фьюжены генов, инсерции и делеции (инделы), однонуклеотидные варианты (SNV), соматические варианты |
Для работы с какими платформами подходит |
NovaSeq 6000 |
Особые типы образцов | кровь, свободноциркулирующая ДНК, циркулирующая опухолевая ДНК |
Технология | Секвенирование |
Рекомендации
Секвенатор | Рекомендуемое количество образцов | Длина прочтения |
---|---|---|
NovaSeq 6000 |
24 образца за запуск (проточная ячейка S4), 800 млн. парных прочтений, покрытие 35000x |
2 × 150 п.о. |
NovaSeq 6000 |
8 образцов за запуск (проточная ячейка S2), 800 млн. парных прочтений, покрытие 35000x |
2 × 150 п.о. |

Преимущества жидкой биопсии
Инновации в молекулярных анализах позволяют проводить всесторонний точный анализ внеклеточной ДНК. Подробнее
Серия TruSight Oncology 500
Продукты серии TruSight Oncology 500 позволяют проводить комплексное геномное профилирование (CGP) на основе биопсии крови и тканей, взятой в домашних условиях. Все три набора в серии предназначены для определения ключевых биомаркеров в гайдлайнах и клинических испытаниях.

TruSight Oncology 500 Assay
Оценка ключевых биомаркеров рака из опухолевой ткани FFPE.

TruSight Oncology 500 High-Throughput Assay
До 192 образцов одновременно, используя те же биомаркеры и тип ткани, что и TruSight Oncology 500.

TruSight Oncology 500 ctDNA Assay
Анализ свободноциркулирующей опухолевой ДНК из плазмы.
Преимущества серии продуктов TruSight Oncology 500

Детальное геномное профилирование
Оценка всех ключевых биомаркеров в гайдлайнах, а также в клинических испытаниях, увеличивает шансы найти положительный биомаркер для каждого образца. Включая все ключевые варианты генома, а также иммуно-онкологические биомаркеры MSI и TMB, панели позволяют лаборатории объединить несколько независимых анализов и рабочих процессов в один, одновременно экономя образцы, время и деньги.

Самостоятельное выполнение анализа
Самостоятельное выполнение анализа позволяет держать образцы и данные под контролем. Благодаря содержанию, включающему в себя как новые, так и уже известные биомаркеры, а также благодаря исследованиям IVD центров в сотрудничестве с несколькими фармацевтическими компаниями, эти анализы предназначены для того, чтобы служить в лаборатории ключевым инструментарием в течение длительного времени.

Интегрированный, универсальный и адаптируемый рабочий процесс
Оценка всех биомаркеров в едином интегрированном 4-5-дневном рабочем процессе, включающем решения для анализа данных вплоть до полного окончательного отчета и интерпретации. Возможность комплексного геномного профилирования на основе образцов твердой или жидкой биопсии при различных количествах образцов.

Надежные результаты
Аналитическая специфичность - 99,999% и аналитическая чувствительность > 95% благодаря надежной химии гибридного захвата, секвенированию методом SBS и тщательно продуманной биоинформатике.
Сравнение наборов
TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput |
TruSight Oncology 500 ctDNA |
|
---|---|---|---|
Тип образцов | FFPE (ДНК и РНК) | FFPE (ДНК и РНК) | Плазма ( сцДНК) |
Количество генов | 523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга |
523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга |
523 гена, относящихся к раку, из ДНК - для анализа SNV, инсерций и делеций (indels) |
Гены, позволяющие обнаружить CNV | 59 генов | 59 генов | 59 генов |
Фьюжены | 55 генов | 55 генов | 23 гена |
Локусы MSI | 130 локусов | 130 локусов | 76 локусов |
Покрытие секвенирования | 3500х |
3500х |
35000х |
Размер панели |
1.94 Mb ДНК 358 kb РНК |
1.94 Mb ДНК 358 kb РНК |
1.94 Mb ДНК |
Для работы с какими платформами подходит |
NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме) NextSeq 500/550 |
NovaSeq 6000 | NovaSeq 6000 |
Производительность |
NextSeq - 8 образцов |
NovaSeq SP - 16 образцов NovaSeq S1 - 32 образцов NovaSeq S2 - 72 образца NovaSeq S4 - 192 образца |
NovaSeq S2 - 8 образцов NovaSeq S4 - 24 образца |
Возможность индексирования |
16 индексов UD TruSight (ДНК и РНК) |
192 индекса IDT for illumina Nextera DNA UD (ДНК и РНК) | 16 индексов UD TruSight (ДНК) |
Количество стартового материала |
40 нг ДНК 40 нг РНК |
40 нг ДНК 40-80 нг РНК |
30 нг сцДНК |
Специфичность (при обнаружении SNV) |
99.9998% |
99.9998% | 99.9995% |
Чувствительность |
>96% |
>96% | >95% |