AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

Панель AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel ― это таргетная панель для количественной оценки экспрессии раковых биомаркеров в 395 генах, связанных с взаимодействием опухолей с иммунной системой.

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

Экспрессия биомаркеров рака при иммунотерапии

Определение уровня экспрессии 395 раковых биомаркеров при иммунотерапии

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день всего из 1 нг высококачественной РНК или из 10 нг образца РНК в FFPE.

Точные данные

Определение экспрессию генов, связанных с взаимодействием опухолей с иммунной системой.

Панель Immune Response является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотеки по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта панель выявляет маркеры, ассоциированные с различными субпопуляциями лейкоцитов, иммунными контрольными точками, презентацией антигенов и развитием опухолевого роста. Готовая к использованию панель экономит Ваше время и усилия, связанные с определением таргетов, разработкой праймеров и оптимизацией панелей.

Спецификации

Время анализа	6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время работы руками	<1,5 часа
Количество ампликонов	всего 398 (1 пул)
Тип нуклеиновой кислоты	РНК
Количество стартового материала	1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого	395 генов, связанных с иммунным ответом
Multiplexing	96 dual index combinations
Для исследования каких видов подходит	Человек
Метод	Amplicon Sequencing, Immunosequencing, Targeted RNA Sequencing
Класс вариаций	Transcript Variants
Для работы с какими платформами подходит	MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме), NextSeq 550
Специальные типы образцов	FFPE, кровь, образцы в малом количестве
Технология	Секвенирование

Рекомендации по работе

Инструмент	Рекомендуемое количество образцов	Длина прочтения
iSeq 100 System	4 образца за запуск (предполагается 1 млн. прочтений на образец)	2 × 150 п.о.
MiniSeq System	Образцов за запуск: mid output: 8, high output: 24 (предполагается 1 млн. прочтений на образец)	2 × 150 п.о.
MiSeq System	Образцов за запуск (в соответствии с версией реагентов): v2 micro: 4, v2: 15, v3: 24(предполагается 1 млн. прочтений на образец)	2 × 150 п.о.

Пример рабочего процесса для конкретного метода

Подготовка
библиотек с помощью:

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

AmpliSeq for Illumina Library PLUS

AmpliSeq for Illumina CD Indexes

Секвенирование на:

MiniSeq System
MiSeq System
NextSeq System

Анализ данных с помощью:

BaseSpace Sequence Hub RNA Amplicon App

Local Run Manager RNA Amplicon Module

Документы для скачивания

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel Gene List AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel Data Sheet