AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer PanelВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel ― это таргетная панель для изучения экзонов 409 известных генов, ассоциируемых с раком. Основные характеристики:

Содержимое набора

Предназначен для изучения 409 генов, связанных с раком.

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE


Точные данные

Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis

Панель Comprehensive Cancer является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек  по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции  (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта панель обнаруживает вариации в генах. ассоциируемых с несколькими типами рака, включая раки легких, толстой кишки, молочной железы, яичников, предстательной железы, меланомы и с гематологическими злокачественными опухолями. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.

Спецификации

Число ампликонов всего 15,992. 4 пула. (Пул 1: 3,996 ампликонов. Пул 2: 4,008 ампликонов. Пул 3: 3,991 ампликонов. Пул 4: 3,997 ампликонов)

Время анализа
6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время ручного труда
<1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты  ДНК
Количество стартового материала 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого Полное покрытие экзоном 409 генов, связанных с раком
Multiplexing  96 dual index combinations
Для исследования каких видов подходит
Человек
Метод Amplicon SequencingTargeted DNA Sequencing
Класс вариаций Copy Number Variants (CNVs), Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме)
 Специальные типы образцов кровь, FFPE
Технология Секвенирование 

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка библиотек с помощью:
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
Секвенирование на: