AmpliSeq for Illumina Myeloid PanelВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком. Myeloid Panel позволяет одновременно анализировать ДНК и РНК из образцов крови и костного мозга для изучения биомаркеров, связанных с гематологическими злокачественными новообразованиями. Панель охватывает соответствующие таргеты для этих основных миелоидных патологий: острый миелоидный лейкоз (ОМЛ), миелоидный диспластический синдром (МДС), миелопролиферативные новообразования (МПН), хронический миелоидный лейкоз (ХМЛ), хронический миеломоноцитарный лейкоз (ЦММЛ) и ювенильный миеломоноцитарный лейкоз (ЮМЛ).


Высококлассное содержимое

Нацеленность на биомаркеры по 69 генам, включая сложные таргеты, такие как CEBPA и FLT3-ITD.

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовьте готовые к секвенированию библиотеки за один день всего из 10 нг высококачественной ДНК и РНК.

Точные данные

Определение соматических мутаций с частотой до 5% с помощью локального или облачного анализа.

Панель AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотеки  по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции  (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта готовая к использованию панель экономит Ваше время и усилия, связанные с определением таргетов, разработкой праймеров и оптимизацией панелей.

Спецификации

Время анализа
5.5 – 7.5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время работы руками
<1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты  РНК, ДНК
Количество стартового материала 20 нг ДНК высокого качества, 10 нг РНК высокого качества (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого Нацеленность на биомаркеры по 69 генам (40 ключевых генов-мишеней ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии)
Описание Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком
Multiplexing до 96-plex
Для исследования каких видов подходит
Человек
Метод Amplicon SequencingTargeted DNA SequencingTargeted RNA Sequencing
Класс вариаций Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq
 Специальные типы образцов ткани FFPE, кровь, образцы в малом количестве
Типы  рака  Гематологические
Технология Секвенирование 

Рекомендации по работе

Инструмент
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
MiniSeq System
Количество образцов за запуск
(mid output): 4 ДНК, 32 РНК, 3 комбинированных образца (на основе> 95% при минимальном охвате в 500 раз)
(high output): 12 ДНК, 96 РНК, 11 комбинированных образца (на основе> 95% при минимальном охвате в 500 раз)
2 × 151 п.о.
MiSeq System
Количество образцов за запуск:
реагенты v2: 7 ДНК, 60 РНК, 6 комбинированных образцов
реагенты v3: 7 ДНК, 60 РНК, 6 комбинированных образцов  
2 × 151 п.о.

Сравнение наборов

   AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 TruSight Myeloid Sequencing Panel 
Время анализа
5.5 – 7.5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) 5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) 8 часов
Время работы руками
<1,5 часа <1,5 часа 3 часа
Тип нуклеиновой кислоты  РНК, ДНК ДНК
ДНК
Количество стартового материала 20 нг ДНК высокого качества, 10 нг РНК высокого качества (рекомендуется 10 нг на пул)
1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул) 50 нг
Особенности содержимого Нацеленность на биомаркеры по 69 генам (40 ключевых генов-мишеней ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии)
Хотспоты 50 генов с известными ассоциациями с раком Нацеленность на 54 гена, связанных с миелоидными злокачественными новообразованиями. Зонды амплифицируют 568 ампликонов из генов-супрессоров опухолей и хотспотов мутаций.
Описание Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком Соматический анализ хотспотов 50 генов, связанных с раком. Для изучения соматических мутаций миелоидных злокачественных новообразований.
Multiplexing до 96-plex 96 dual index combinations до 96-plex
Для исследования каких видов подходит
Человек Человек
Человек
Метод Amplicon SequencingTargeted DNA SequencingTargeted RNA Sequencing
Amplicon SequencingTargeted DNA Sequencing
Amplicon SequencingTargeted DNA Sequencing
 Специальные типы образцов ткани FFPE, кровь, образцы в малом количестве ткани FFPE, кровь
Не совместим с FFPE

Высокий охват гена CEBPA

high-coverage-of-cebpa-gene.jpg

ДНК, оцененная с помощью AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel, показывает высокую глубину покрытия по всему транскрипту гена.


Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
Секвенирование на: