AmpliSeq for Illumina Immune Response PanelВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

Панель AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel ― это таргетная панель для количественной оценки экспрессии раковых биомаркеров в 395 генах, связанных с взаимодействием опухолей с иммунной системой. 
Ключевые особенности:

Экспрессия биомаркеров рака при иммунотерапии

Определение уровня экспрессии 395 раковых биомаркеров при иммунотерапии

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день всего из 1 нг высококачественной РНК или из 10 нг образца  РНК в FFPE.


Точные данные

Определение экспрессию генов, связанных с взаимодействием опухолей с иммунной системой.

Панель Immune Response является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотеки  по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции  (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта панель выявляет маркеры, ассоциированные с различными субпопуляциями лейкоцитов, иммунными контрольными точками, презентацией антигенов и развитием опухолевого роста. Готовая к использованию панель экономит Ваше время и усилия, связанные с определением таргетов, разработкой праймеров и оптимизацией панелей.

Спецификации

Время анализа
6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время работы руками
<1,5 часа
 Количество ампликонов  всего 398 (1 пул)
Тип нуклеиновой кислоты  РНК
Количество стартового материала 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого 395 генов, связанных с иммунным ответом
Multiplexing  96 dual index combinations
Для исследования каких видов подходит
Человек
Метод Amplicon Sequencing, Immunosequencing, Targeted RNA Sequencing
Класс вариаций Transcript Variants
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме), NextSeq 550
 Специальные типы образцов  FFPE, кровь, образцы в малом количестве
Технология Секвенирование 

Рекомендации по работе

Инструмент
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
iSeq 100 System
4 образца за запуск (предполагается 1 млн. прочтений на образец) 2 × 150 п.о.
MiniSeq System
Образцов за запуск: mid output: 8, high output: 24 (предполагается 1 млн. прочтений на образец) 2 × 150 п.о.
MiSeq System Образцов за запуск (в соответствии с версией реагентов): v2 micro: 4, v2: 15, v3: 24(предполагается 1 млн. прочтений на образец)
2 × 150 п.о.

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
Секвенирование на: