TruSight Oncology 500 ctDNAВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSight Oncology 500 ctDNA 

Панель, нацеленная на исследование множественных соматических вариантов, включая мутационную нагрузку опухоли (TMB) и микросателлитную нестабильность (MSI), из образцов из плазмы.

Эта NGS-панель позволяет провести комплексное геномное профилирование опухоли на основе свободноциркулирующей ДНК (cfDNA) и оценивает множественные варианты в 523 генах, связанных с раком.


Комплексное геномное профилирование образцов из плазмы

То же содержание, что и в TruSight Oncology 500, для обнаружения однонуклеотидных вариантов (SNV), инделов, CNV, фьюженов ДНК, TMB и MSI

Быстрое и точное обнаружение вариантов

Усовершенствованный алгоритм определения вариантов, усиленный и ускоренный DRAGEN

Уверенность в результатах

Химия гибридного захвата, UMI и значительная глубина покрытия, а также тщательно продуманная коррекция ошибок улучшают определение вариантов и уменьшает случайные эффекты

Мощность секвенатора NovaSeq 6000

Анализ cfDNA с необходимой мощностью секвенирования для обнаружения редких вариантов в плазме

Спецификации

Тип нуклеиновой кислоты  ДНК
Для исследования каких видов подходит
Человек
Тип рака Пан-раковый анализ
Метод Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование
Класс вариантов Варианты числа копий (CNV), фьюжены генов, инсерции и делеции (инделы), однонуклеотидные варианты (SNV), соматические варианты
Для работы с какими платформами подходит NovaSeq 6000
 Особые типы образцов кровь, свободноциркулирующая ДНК, циркулирующая опухолевая ДНК
Технология Секвенирование 

Рекомендации

Секвенатор Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения 
NovaSeq 6000
24 образца за запуск (проточная ячейка S4), 800 млн. парных прочтений, покрытие 35000x
2 × 150 п.о. 
NovaSeq 6000 8 образцов за запуск (проточная ячейка S2), 800 млн. парных прочтений, покрытие 35000x
2 × 150 п.о.  

Преимущества жидкостной биопсии

Преимущества жидкой биопсии

Инновации в молекулярных анализах позволяют проводить всесторонний точный анализ внеклеточной ДНК. Подробнее


Серия TruSight Oncology 500

Продукты серии TruSight Oncology 500 позволяют проводить комплексное геномное профилирование (CGP) на основе биопсии крови и тканей, взятой в домашних условиях. Все три набора в серии предназначены для определения ключевых биомаркеров в гайдлайнах и клинических испытаниях.  

TruSight Oncology 500

TruSight Oncology 500 Assay

Оценка ключевых биомаркеров рака из опухолевой ткани FFPE.

TruSight Oncology 500 High-Throughput

TruSight Oncology 500 High-Throughput Assay

До 192 образцов одновременно, используя те же биомаркеры и тип ткани, что и TruSight Oncology 500.

TruSight Oncology 500 ctDNA

TruSight Oncology 500 ctDNA Assay

Анализ свободноциркулирующей опухолевой ДНК из плазмы.

Преимущества серии продуктов TruSight Oncology 500

Детальное геномное профилирование

Детальное геномное профилирование

Оценка всех ключевых биомаркеров в гайдлайнах, а также в клинических испытаниях, увеличивает шансы найти положительный биомаркер для каждого образца. Включая все ключевые варианты генома, а также иммуно-онкологические биомаркеры MSI и TMB, панели позволяют лаборатории объединить несколько независимых анализов и рабочих процессов в один, одновременно экономя образцы, время и деньги.

Самостоятельное выполнение анализа

Самостоятельное выполнение анализа

Самостоятельное выполнение анализа позволяет держать образцы и данные под контролем. Благодаря содержанию, включающему в себя как новые, так и уже известные биомаркеры, а также благодаря исследованиям IVD центров  в сотрудничестве с несколькими фармацевтическими компаниями, эти анализы предназначены для того, чтобы служить в лаборатории ключевым инструментарием в течение длительного времени.

Интегрированный универсальный и адаптируемый рабочий процесс

Интегрированный, универсальный и адаптируемый рабочий процесс

Оценка всех биомаркеров в едином интегрированном 4-5-дневном рабочем процессе, включающем решения для анализа данных вплоть до полного окончательного отчета и интерпретации. Возможность комплексного геномного профилирования на основе образцов твердой или жидкой биопсии при различных количествах образцов.

Надежные результаты

Надежные результаты

Аналитическая специфичность - 99,999% и аналитическая чувствительность > 95% благодаря надежной химии гибридного захвата, секвенированию методом SBS и тщательно продуманной биоинформатике.

Сравнение наборов

  TruSight Oncology 500  TruSight Oncology 500 High-Throughput  TruSight Oncology 500 ctDNA
Тип образцов  FFPE (ДНК и РНК)     FFPE (ДНК и РНК)  Плазма ( сцДНК)   
Количество генов 523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга      523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга 
523 гена, относящихся к раку, из ДНК - для анализа SNV, инсерций и делеций (indels)      
Гены, позволяющие обнаружить CNV      59 генов     59 генов     59 генов    
Фьюжены  55 генов  55 генов   23 гена 
Локусы MSI  130 локусов  130 локусов   76 локусов  
Покрытие секвенирования  3500х  3500х 
35000х  
Размер панели  1.94 Mb ДНК
358 kb РНК
1.94 Mb ДНК
358 kb РНК 
1.94 Mb ДНК
Для работы с какими платформами подходит
NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме)
NextSeq 500/550
NovaSeq 6000  NovaSeq 6000 
Производительность
NextSeq - 8 образцов
NovaSeq SP - 16 образцов
NovaSeq S1 - 32 образцов
NovaSeq S2 - 72 образца
NovaSeq S4 - 192 образца
NovaSeq S2 - 8 образцов
NovaSeq S4 - 24 образца
Возможность индексирования
16 индексов UD TruSight (ДНК и РНК)
192 индекса IDT for illumina Nextera DNA UD (ДНК и РНК)  16 индексов UD TruSight (ДНК) 
Количество стартового материала 40 нг ДНК
40 нг РНК
40 нг ДНК
40-80 нг РНК 
30 нг сцДНК
Специфичность (при обнаружении SNV)
99.9998%
99.9998%  99.9995% 
Чувствительность
>96%
>96%  >95%