MiniSeq

Простой и доступный секвенатор нового поколения

Качество и надежность технологии Illumina в компактном и доступном по цене секвенаторе! MiniSeq позволит Вашей лаборатории сделать NGS рутинным методом. MiniSeq подойдет для лабораторий любого размера - как для крупных, так и с небольшим потоком образцов.

MiniSeq сочетает в себе лучшие черты секвенаторов MiSeq и NextSeq: использование одноразовых картриджей с реагентами и упрощённую систему флюидики. MiniSeq обеспечивает исключительную скорость работы, и, при своих компактных размерах, позволяет получить до 7,5 Гб данных и порядка 25 млн. чтений всего за сутки.

Доступный настольный секвенатор

MiniSeq является одним из самых доступных секвенаторов, который обладает производительностью и надёжностью проверенной технологии NGS от Illumina. С MiniSeq секвенирование даже небольшого количества образцов является экономически выгодным. Его оптимизированный рабочий процесс обеспечивает быстрое секвенирование как ДНК, так и РНК. Небольшой размер позволяет легко разместить MiniSeq в лаборатории, не требуя специализированного вспомогательного оборудования.

Применения системы MiniSeq

Система MiniSeq позволяет исследователям легко переключаться между проектами, связанными с  секвенированием как ДНК, так и РНК, включая профилирование путей передачи сигналов, профилирование твердых и гематологических опухолей и анализ герминативных мутаций.

Рабочий процесс: простой путь от библиотек к результатам

Система MiniSeq сочетает в себе лёгкость эксплуатации с интуитивно понятным пользовательским интерфейсом. Генерация кластеров и секвенирование объеденины в одном компактном настольном секвенаторе, благодаря чему у Вас не будет необходимости в дополнительном оборудовании. Просто загрузите проточную ячейку и картридж с реагентами в MiniSeq и запустите сиквенс одним нажатием кнопки. Вы можете посмотреть, как это просто в этой интерактивной демонстрации.
Подробнее прочесть о применении MiniSeq Вы можете здесь.

Удобное и интуитивно-понятное программное обеспечение

Мониторинг и анализ запуска секвенатора выполняется с помощью встроенного программного обеспечения, не требующего подключения к интернету. Прибор сам сделает за Вас сборку de novo или выравнивание на референсный геном и variant calling.

Генерация кластеров и секвенирование*

*Спецификации установки основаны на библиотеке управления Illumina PhiX при поддерживаемых размерах кластеров (129-165 k/mm2 clusters passing filter). Фактические параметры производительности могут варьироваться в зависимости от типа пробы, качества выборки и clusters passing filter. Все комплекты MiniSeq совместимы paired-end. Общее время включает генерацию кластеров, секвенирование и распознавание азотистых оснований с оценкой качества на системе MiniSeq.
  Длина прочтения, п.о. Общее время, ч Мощность
MiniSeq System
High-Output Kit
2 × 150
≈24 6,6-7,5 Гб
2 × 75
13 3,3-3,75 Гб
MiniSeq System
Mid-Output Kit
1 × 75 7 1,65-1,875 Гб
2 × 150 17 2,1-2,4 Гб

Фильтр прочтений или прохождения кластеров


MiniSeq System High-Output Kit
MiniSeq System Mid-Output Kit
Single Reads
22–25 млн.
7-8 млн.
Paired-End Reads
44–50 млн. 14-16 млн.

Показатели качества*

* Процент оснований >Q30 усреднён за полный запуск. Оценка качества (Q-score) ― это предсказание вероятности ошибки в распознавании азотистых оснований.
MiniSeq System High-Output Kit
MiniSeq System Mid-Output Kit
> 80% оснований выше, чем Q30 (2 × 150 п.о.)
> 80% оснований выше, чем Q30 (2 × 150 п.о.)
> 85% оснований выше, чем Q30 (2 × 75 п.о.)

> 85% оснований выше, чем Q30 (1 × 75 п.о.)

Эти характеристики делают MiniSeq подходящим для решения следующих задач:

1) Онкология

- анализ соматических мутаций в солидных опухолях (панели TruSight Tumor 15, линейка панелей AmpliSeq) и миелоидных новообразованиях (TruSight Myeloid)
- анализ предрасположенности к онкологическим заболеваниям (TruSight Cancer, панели AmpliSeq)
- исследование ракового транскриптома (TruSight Pan-Cancer) и фьюжнов (TruSight RNA Fusion, линейка панелей Archer Dx)
 
2) РНК-секвенирование

- кастомные панели TruSeq Targeted RNA Expression для оценки экспрессии генов
- RNA-Seq микроорганизмов, секвенирование РНК-вирусов
- изучение малых РНК (TruSeq Small RNA)
 
3) Таргетное секвенирование

- широкий выбор панелей для любых задач.
  
4) Полногеномное секвенирование небольших геномов (до 5 Mb)

Видеоссылки