TruSight HLA v2 Sequencing Panel

Панель для HLA типирования на основе проверенной технологии  NGS от Illumina и программного обеспечения Assign analysis software.

TruSight HLA v2 Sequencing Panel позволяет провести типирование для определения лейкоцитарного антигена человека (HLA) со сверхвысоким разрешением и широком покрытием для простой и быстрой оценки участков HLA в одном анализе. Особенности:

  • Секвенирование с высоким разрешением для 11 локусов HLA

  • Рабочий процесс включает в себя подготовку библиотек, секвенирование и анализ данных / составление отчетов

  • Достоверное HLA-типирование с высоким разрешением для однозначных результатов


Захват целых HLA генов

TruSight HLA v2 охватывает все типированные локусы HLA, а также те, которые приобретают значимость для современных исследований. Эта панель позволяет секвенировать класс I HLA-A, B и C; класс II HLA-DRB1 / 3/4/5, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DPA1 и HLA-DPB1. Это расширяет покрытие за пределы классических локусов, позволяет осуществить покрытие целых генов, что открывает новые аллели без необходимости конструировать новые праймеры.

Рабочий процесс от подготовки образца до отчета с оптимизированным анализом данных

Комплексное решение включает реагенты и программное обеспечение, оптимизированное для анализа HLA. Упрощенный рабочий процесс  занимает менее 48 часов (при 4,5 часах непосредственно ручной работы) и повышает эффективность работы лаборатории. Программное обеспечение, установленное на приборе, анализирует данные секвенирования; TruSight HLA Assign Software предоставляет гибкие возможности для составления отчетов о результатах после анализа.

Высокая точность HLA-типирования

Расширенный покрытие TruSight HLA v2 обеспечивает высокое разрешение, исключая необходимость повторного тестирования для получения достоверного результата типирования.

Как работает TruSight HLA v2

TruSight HLA v2 амплифицирует локусы HLA с помощью “long-range” ПЦР. После амплификации тагментаза Nextera фрагментирует ДНК и добавляет фланкирующие последовательности. Затем дополнительная ПЦР добавляет адаптерные и индексные последовательности для создания готовых к секвенированию библиотек ДНК. Подготовленные библиотеки затем загружаются непосредственно в систему MiniSeq, MiSeq или NextSeq для секвенирования.

Основные характеристики программного обеспечения для анализа

Программное обеспечение Assign 2.0 TruSight HLA для анализа помогает при назначении типа человеческого лейкоцитарного антигена (HLA). Программное обеспечение предназначено для анализа данных из библиотек, подготовленных с помощью TruSight HLA Sequencing Panels и затем секвенированных на платформах Illumina. Используйте Assign 2.0 для импорта данных секвенирования, распознавания азотистых оснований, редактирования последовательностей и сравнения образцов консенсусной последовательности с IMGT/HLA базой данных аллелей.

Спецификации

Время анализа  48 часов 
Время непосредственно ручной работы  4,5 часа 
Количество стартового материала 400 нг ДНК
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме), NextSeq 500, NextSeq 550
Класс вариантов Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
Для исследования каких видов подходит Человек

Рабочий процесс (от подготовки библиотек до отчёта) для HLA-типирования

TruSight HLA v2 Sequencing Panel обеспечивает повышенную точность и эффективность при HLA -типировании по сравнению с TruSight HLA v1, весь рабочий процесс занимает менее чем 48 часов при 4-х часах непосредственно ручной работы.


Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
Секвенирование на:
MiniSeq System
MiSeq System
NextSeq 550 System
Анализ данных с помощью: