TruSight RNA Fusion PanelВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSight RNA Fusion Panel

Обеспечивает комплексное обнаружение фьюженов генов в FFPE-образцах и в образцах других типов.

Эта таргетная панель для секвенирования РНК является экономически выгодным решением для обнаружения фьюженов генов при множественных типах рака, независимо от источника. Охватывая 507 образующих фьюжены генов, одна панель позволяет исследователям оценить большинство известных фьюженов, ассоциированных с раком, в образцах крови, костного мозга и FFPE, и позволяет идентифицировать новые фьюжен-партнёры генов.


  • Содержимое для всестороннего обзора фьюженов генов, ассоциированных с раком, выявления известных и новых фьюженов

  • От РНК до результатов - 4 дня

  • Совместимость с настольными секвенаторами для проведения экономически выгодных исследований

  • Оптимизированное секвенирование РНК для всех типов образцов, включая ткани FFPE

Простой отчет о фьюженах для клиентов, впервые работающих с NGS

Встроенное в прибор ПО обеспечивает обнаружение фьюженов, что удобно для лабораторий без дополнительной биоинформатической поддержки. Анализ предоставляет список обнаруженных фьюженов, ассоциируемых с заболеваниями по базе данных Мителмана.

Надежная панель для исследования фьюженов, демонстрирующая воспроизводимость результатов, работающая с малым количеством стартового материала

Для работы с данной панелью достаточно 20 нг FFPE РНК или 10 нг свежезамороженной РНК. TruSight RNA Fusion Panel обеспечивает надёжные, воспроизводимые результаты и является экономически выгодным решением для изучения фьюженов генов в исследованиях рака.

Спецификации

Время анализа
2,5 дня
Время непосредственно ручной работы
11 часов
Количество стартового материала 10 нг РНК, 20–100 нг FFPE РНК
Тип рака Pan-Cancer, Солидные Опухоли
Особенности содержимого Панель, направленная на исследование 507 генов, образующих фьюжены, и включающая 7690 экзонов.
Описание Позволяет исследовать фьюжены с участием как известных, так и новых, не описанных ранее партнёров, с простым биоинформатическим анализом.
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме), NextSeq 500, NextSeq 550
Класс вариаций Фьюжены генов
Тип нуклеиновой кислоты РНК
Специализированные типы образцов FFPE-ткани; малое количество стартового материала
Метод Таргетное ОбогащениеТаргетное РНК Секвенирование
Для исследования каких видов подходит Человек
Технология Секвенирование

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
MiniSeq Образцов за запуск: mid output: 2-3, high output: 8 (на основе 3 млн. прочтений на образец) 2 × 76 п.о.(рекомендуемый максимум)
MySeq          8 образцов за запуск с реагентами v3 (из расчета 3 млн. прочтений на образец)
2 × 76 п.о.(рекомендуемый максимум)
NextSeq 550         24 образца за запуск (mid output; из расчета 3 млн. прочтений на образец) 2 × 76 п.о.(рекомендуемый максимум)

Сравнение наборов

       TruSight RNA Fusion Panel
TruSight Tumor 170
AmpliSeq for Illumina Focus Panel
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
Время анализа
2,5 дня ~ 2 дня (подготовка библиотеки)   ~6 часов -  общее время анализа
 Время непосредственно ручной работы  11 часов 4 часа   ~4 часа
Количество стартового материала 10 нг РНК, 20–100 нг FFPE РНК
40 нг ДНК и / или РНК    1–100 нг (10 нг рекомендуется на пул) 1–100 нг (10 нг рекомендуется на пул)
Тип рака Пан-Рак, Солидная Опухоль
Солидная Опухоль
Солидная Опухоль
Солидная Опухоль
Для исследования каких видов подходит
Человек
Человек
Человек
Человек
Метод Таргетное ОбогащениеТаргетное РНК Секвенирование
Таргетное ОбогащениеТаргетное РНК СеквенированиеТаргетное ДНК Секвенирование
Секвенирование ампликоновТаргетное РНК СеквенированиеТаргетное ДНК Секвенирование
Секвенирование ампликоновТаргетное РНК СеквенированиеТаргетное ДНК Секвенирование
Тип нуклеиновой кислоты РНК РНК, ДНК ДНК, РНК ДНК, РНК
 Специальные типы образцов ткани FFPE; малое количество стартового материала
ткани FFPE; малое количество стартового материала
ткани FFPE, кровь
ткани FFPE, кровь

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
Секвенирование на:
MiniSeq System
MiSeq System
NextSeq 550 System
Анализ данных с помощью: