AmpliSeq for Illumina Focus PanelВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

AmpliSeq for Illumina Focus Panel

AmpliSeq for Illumina Focus Panel ― это панель для анализа биомаркеров 52 генов, ассоциируемых с развитием солидными опухолей. C помощью данной панели можно анализировать как ДНК, так и РНК одновременно. Ключевые особенности:

Содержимое набора

Панель нацелена на изучение биомаркеров 52 генов, ассоциируемых с развитием солидных опухолей.

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE


Точные данные

Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis

Панель Focus является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек  по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции  (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.

Спецификации

Число ампликонов всего 553, 2 пула (ДНК пул: 269 ампликонов. РНК пул: 284 ампликонов.)
Время анализа
5-6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время ручного труда
<1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты  ДНК
Количество стартового материала 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого таргеты ДНК и РНК для 52 онкогенов
Multiplexing  96 dual index combinations
 Механизм действия  Мультиплексная ПЦР
Для исследования каких видов подходит
Человек
Метод Amplicon SequencingTargeted DNA SequencingTargeted RNA Sequencing
Класс вариаций Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит iSeq 100, MiniSeq, 
MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме)
 Специальные типы образцов кровь, FFPE
Технология Секвенирование 

Равномерность охвата

ampliseq-for-Illumina-focus-panel-web-graphic-1.jpg

ДНК, выделенную из образца ткани FFPE невысокого качества и образцов высокого качества, оценивали на наборе AmpliSeq for Illumina Focus Panel и секвенировали на системах MiniSeq и MiSeq. Cq - показатель качества ДНК, изолированного из тканей FFPE.

Высокое соответствие между ожидаемой и обнаруженной вариацией частоты

ampliseq-for-Illumina-focus-panel-web-graphic-2.jpg

ДНК, выделенную из образца ткани FFPE высокого качества, оценивали на наборе AmpliSeq for Illumina Focus Panel и секвенировали на системах MiniSeq и MiSeq. Результаты показали 100% совпадение с ожидаемой частотой.


Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка библиотек с помощью:
AmpliSeq for Illumina Focus Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
Секвенирование на: