TruSight Tumor 15

Оценка 15 генов, которые обычно мутируют в солидных опухолях, в одной панеле с простым и быстрым рабочим процессом.

TruSight Tumor 15 использует технологию секвенирования следующего поколения (NGS) для комплексной оценки 15 генов, которые обычно мутируют в солидных опухолях. Он достоверно обнаруживает редко встречающиеся варианты из 20 нг исходной ДНК и оптимизирован для работы с FFPE образцами опухолевых тканей.

Список включённых генов >>


Преимущества TruSight Tumor 15:

Панель позволяет разом оценить 15 генов вместо отдельной оценки каждого гена с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Всего 3,5 часа работы непосредственно руками (от ДНК до получения данных примерно 36 часов).

Соматические варианты, включённые в панель, выбраны в соответствии с актуальными гайдами, данными экспертов и фармацевтических исследований.

Высокочувствительное обнаружение вариантов при низком количестве стартового ДНК: достоверное определение соматического варианта с частотой аллеля 5% из 20 нг ДНК из FFPE образцов ткани.

TruSight Tumor 15: данные по образцам

3 референсных человеческих образца и 5 FFPE образцов ДНК из опухолей легких, толстой кишки, меланомы и молочной железы были приготовлены с использованием TruSight Tumor 15. Эти библиотеки были секвенированы на системе MiniSeq с использованием high output kit с длиной прочтения 2 x 150 п.о. с двойной индексацией. Общий выход составил 7,6 Gb с 94,9% оснований на уровне Q30 или выше.

Ссылка на исследование >>

Спецификации

Время анализа
7 часов
Время непосредственно ручной работы
3,5 часа
Количество стартового материала 20 нг
Тип рака Солидная Опухоль
       Описание Панель для изучения соматических вариантов солидных опухолей в 15 генах,  с простым рабочим процессом.
Особенности содержимого Амплифицирует 250 ампликонов из 15 генов, связанных с солидными опухолями
 Мультиплексирование 1-24-plex
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме)
Класс вариантов Инделы, Соматические варианты
Тип нуклеиновой кислоты ДНК
Специализированные типы образцов FFPE-ткани
Метод Amplicon SequencingTargeted DNA Sequencing
Для исследования каких видов подходит Человек
Технология Секвенирование

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
MiniSeq              Образцов за запуск: mid output: 2-3, high output: 8 (из расчета 93,5% оснований с покрытием минимумом 500 раз)
2 × 150 п.о.(рекомендуемый максимум)
MiSeq 8 образцов за запуск с v3 reagents (из расчета 93,5% оснований с покрытием минимумом 500 раз) 2 × 151 п.о.(рекомендуемый максимум)

Список включённых в TruSight Tumor 15 генов

AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53