TruSight Oncology 500ВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSight Oncology 500

Панель, нацеленная на исследование множественных вариантов, включая мутационную нагрузку опухоли (TMB) и микросателлитную нестабильность (MSI), даже из образцов низкого качества.

TruSight Oncology 500 - это NGS-панель для профилирования опухолей, которая анализирует сотни связанных с раком биомаркеров. Она способна распознать все релевантные варианты ДНК и РНК*, связанные с различными типами опухолей.

Кроме того, данная панель точно измеряет ключевые биомаркеры иммунотерапии: мутационную нагрузку опухоли (TMB) и микросателлитную нестабильность (MSI).


Экономия времени, денег и образцов благодаря консолидации тестов

  • Содержимое по пан-раковому анализу соответствует основным клиническим рекомендациям

  • Панель ДНК+РНК*, охватывает 523 гена для оценки всех типов вариантов ДНК и РНК, ТМВ, MSI, сплайс-вариантов и фьюженов

  • Определение релевантных вариантов при высокоточных результатах

Высокоточные результаты

  • Программные фильтры артефактов для точного определения вариантов

  • Химия обогащения, включая уникальные молекулярные индексы (UMI), для высокой чувствительности при обнаружении вариантов

  • Основано на проверенной платформе Illumina

Иммуно-онкология

  • Панель содержит иммуноонкологические биомаркеры TMB и MSI

  • Рабочий процесс включает работу только с опухолью

  • Качество определения TMB при использовании TruSight Oncology 500  аналогично качеству определения при использовании панелей для секвенирования полного экзома (WES)

  • Большая панель размером 1,94 Mb и сложный алгоритм для точной оценки TMB

* Для определения вариантов ДНК и РНК используются панели TruSight Oncology 500 DNA и TruSight Tumor 170 RNA

Спецификации

Количество генов 523 гена для ДНК, 55 генов для РНК 
Время анализа
4-5 дней от образца до результата
Время работы руками
~ 10,5 часов
Тип нуклеиновой кислоты  РНК, ДНК
Примечание относительно типа нуклеиновой кислоты Для определения вариантов ДНК и РНК используются панели TruSight Oncology 500 DNA и TruSight Tumor 170 RNA
Аналитическая специфичность
99,9998% (при обнаружении SNV) 
Аналитическая чувствительность
> 96% 
Количество стартового материала 40 нг ДНК, 40 нг РНК
Особенности содержимого • Таргетные участки ДНК из 523 генов, представляющих интерес, и РНК из 55 генов, при общем размере панели 1,94 Mb.
• Охват гайдлайнов: широкий охват ключевых гайдлайнов по множественным типам солидных опухолей. 
• Охват клинических испытаний: более 1000 клинических испытаний. 
• Охват иммуно-онкологических биомаркеров: охват биомаркеров MSI , а также появляющихся биомаркеров TMB, POLE1 и POLD1.
Мультиплексирование До 8-плексного значения
Механизм действия Рабочий процесс основанный на таргетном обогащении
Для исследования каких видов подходит
Человек
Тип рака Пан-раковый анализ
Метод Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование, Таргетное РНК секвенирование
Класс вариантов Варианты числа копий (CNV), фьюжены генов, инсерции и делеции (инделы), однонуклеотидные варианты (SNV), варианты транскриптов
Для работы с какими платформами подходит NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме)
 Особые типы образцов ткани FFPE
Технология Секвенирование 
Возможность автоматизации Автоматические станции пипетирования

Служба аналитической оценки и проверки TruSight Oncology 500

Служба аналитической оценки и проверки

Служба аналитической оценки TruSight Oncology 500 (сервис доступен не для всех стран и регионов) - это набор инструментов, предназначенных для того, чтобы помочь исследованиям соответствовать новейшим стандартам CAP, AMP и европейским стандартам. В файле по ссылке далее предоставлены рекомендации, которые помогут интегрировать продукты в рабочий процесс. Подробнее


Обнаружение актуальных в настоящее время вариантов ДНК и РНК* различных типов рака.
Некоторые ключевые биомаркеры включают в себя:

биомаркеры TSO 500

Гены и биомаркеры, перечисленные в этой таблице, являются подмножеством всех генов, включенных в панель. Чтобы увидеть полный список генов, просмотрите спецификацию, доступную в разделе "Документы для скачивания" на этой странице.

* Для определения вариантов ДНК и РНК используются панели TruSight Oncology 500 DNA и TruSight Tumor 170 RNA


Серия TruSight Oncology 500

Продукты серии TruSight Oncology 500 позволяют проводить комплексное геномное профилирование (CGP) на основе биопсии крови и тканей, взятой в домашних условиях. Все три набора в серии предназначены для определения ключевых биомаркеров в гайдлайнах и клинических испытаниях.    

TruSight Oncology 500

TruSight Oncology 500 Assay

Оценка ключевых биомаркеров рака из опухолевой ткани FFPE.

TruSight Oncology 500 High-Throughput

TruSight Oncology 500 High-Throughput Assay

До 192 образцов одновременно, используя те же биомаркеры и тип ткани, что и TruSight Oncology 500.

TruSight Oncology 500 ctDNA

TruSight Oncology 500 ctDNA Assay

Анализ свободноциркулирующей опухолевой ДНК из плазмы.

Преимущества серии продуктов TruSight Oncology 500

Детальное геномное профилирование

Детальное геномное профилирование

Оценка всех ключевых биомаркеров в гайдлайнах, а также в клинических испытаниях увеличивает шансы найти положительный биомаркер для каждого образца. Включая все ключевые варианты генома, а также иммуно-онкологические биомаркеры MSI и TMB, панели позволяют лаборатории объединить несколько независимых анализов и рабочих процессов в один, одновременно экономя образцы, время и деньги.

Самостоятельное выполнение анализа

Самостоятельное выполнение анализа

Самостоятельное выполнение анализа позволяет держать образцы и данные под контролем. Благодаря содержанию, включающему в себя как новые, так и уже известные биомаркеры, а также благодаря исследованиям IVD центров в сотрудничестве с несколькими фармацевтическими компаниями, эти анализы предназначены для того, чтобы служить в лаборатории ключевым инструментарием в течение длительного времени.

Интегрированный универсальный и адаптируемый рабочий процесс

Интегрированный, универсальный и адаптируемый рабочий процесс

Оценка всех биомаркеров в едином интегрированном 4-5-дневном рабочем процессе, включающем решения для анализа данных вплоть до полного окончательного отчета и интерпретации. Возможность комплексного геномного профилирования на основе образцов твердой или жидкой биопсии при различных количествах образцов.

Надежные результаты

Надежные результаты

Аналитическая специфичность - 99,999% и аналитическая чувствительность > 95% благодаря надежной химии гибридного захвата, секвенированию методом SBS и тщательно продуманной биоинформатике.

Сравнение наборов

  TruSight Oncology 500  TruSight Oncology 500 High-Throughput  TruSight Oncology 500 ctDNA
Тип образцов  FFPE (ДНК и РНК)     FFPE (ДНК и РНК)  Плазма ( сцДНК)   
Количество генов 523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга     523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV и инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга      523 гена, относящихся к раку, из ДНК - для анализа SNV, инсерций и делеций (indels)        
Гены, позволяющие обнаружить CNV 
59 генов     59 генов     59 генов    
Фьюжены  55 генов  55 генов   23 гена 
Локусы MSI  130 локусов  130 локусов   76 локусов  
Покрытие секвенирования  3500х  3500х 
35000х  
Размер панели  1.94 Mb ДНК
358 kb РНК
1.94 Mb ДНК
358 kb РНК 
1.94 Mb ДНК
Для работы с какими платформами подходит
NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме)
NextSeq 500/550
NovaSeq 6000  NovaSeq 6000 
Производительность
NextSeq - 8 образцов
NovaSeq SP - 16 образцов
NovaSeq S1 - 32 образцов
NovaSeq S2 - 72 образца
NovaSeq S4 - 192 образца
NovaSeq S2 - 8 образцов
NovaSeq S4 - 24 образца
Возможность индексирования
16 индексов UD TruSight (ДНК и РНК)
192 индекса IDT for illumina Nextera DNA UD (ДНК и РНК)  16 индексов UD TruSight (ДНК) 
Количество стартового материала 40 нг ДНК
40 нг РНК
40 нг ДНК
40-80 нг РНК 
30 нг сцДНК
Специфичность (при обнаружении SNV)
99.9998%
99.9998%  99.9995% 
Чувствительность
>96%
>96%  >95% 


Оценка TruSight Oncology 500 европейскими лабораториями
Оценка TruSight Oncology 500 европейскими лабораториями
Ведущие европейские онкологические центры оценили TruSight Oncology 500 (TSO500). Узнайте больше об их опыте в этой статье.
Подробнее
high-concordance-between-tmb-measurements-from-TruSight-Oncology-500-and-whole-exome-sequencing.png
Вспомогательные данные и количественные показатели
Высокая согласованность между измерениями TMB при использовании TruSight Oncology 500 и при секвенировании полного экзома
Подробнее
quantitative-assessment-of-msi-status-versus-MSI-PCR-score (1).png
Вспомогательные данные и количественные показатели
Количественная оценка статуса MSI в сравнении с оценкой MSI-PCR
Подробнее
reproducible-tmb-evaluation-with-tumor-only-or-tumor-normal-workflow.png
Вспомогательные данные и количественные показатели
Воспроизводимая оценка TMB в рабочем процессе  как с образцами, представленными только опухолью, так и парными образцами из опухоли и нормальной ткани
Подробнее
small-variant-detection-at-low-variant-allele-frequency.png
Вспомогательные данные и количественные показатели
Обнаружение малых вариантов при низкой частоте вариантного аллеля
Подробнее
trusight-oncology-500-content-alignment-to-nccn-guidelines.png
Вспомогательные данные и количественные показатели
Согласование содержания TruSight Oncology 500 с рекомендациями NCCN
Подробнее