TruSeq Genotype Ne KitВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSeq Genotype Ne Kit

TruSeq Genotype Ne Kit ― это кастомная панель для установления родства, подтверждения чистоты породы/сорта и маркер-ассоциированной селекции. Данный набор позволяет проводить таргетное генотипирование любых видов животных и растений (кроме человека) медотом секвенирования.

Решение направлено на севенирование отдельных точек, а не генов целиком. 

Панель может включать 16 – 5000 исследуемых маркеров (SNPs, инсерции, делеции), мультиплекс до 384 образцов за реакцию.


Размер ампликонов: 150 bp и 175 bp. При этом, можно задавать маркеры без полностью собранного референсного генома. 

Вы можете настроить индивидуальный дизайн панели с помощью программы Illumina Concierge. Несложно обновить панель в случае открытия новых маркеров.

В набор входят все реагенты для приготовления индексированных библиотек и секвенирования.

Удобный и автоматизированный рабочий процесс позволяет получить данные менее чем за 2 дня.

Анализ данных осуществляется с помощью стандартной программы TruSeq Amplicon BaseSpace App.

Минимальный заказ ― из расчета на 384 образца, далее + кратно 96.

Подготовка библиотеки с помощью TruSeq Genotype Ne truseq-genotype-n.jpg

Спецификации

Для работы с какими платформами подходит     MiniSeqMiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550
Для исследования каких видов подходит
Растение, млекопитающее, креветка, КРС, мышь, собака, рис, овечка, курица, свинья, крыса, кукуруза, соя
Дополнительная информация о видах Любое животное или растение (кроме человека)
 Возможности автоматизации Liquid Handling Robots
Класс вариаций Germline Variants, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
Метод Amplicon Sequencing, Custom Sequencing, Genotyping by SequencingTargeted DNA Sequencing
 Время анализа ~ 6 часов
Время ручного труда
3 часа
Количество стартового материала 50 нг ДНК
Особенности содержимого Индивидуальный дизайн для секвенирования тех областей генома, которые представляют интерес. 
16 – 5000 исследуемых маркеров
 Механизм действия  Probe hybridization, extension-ligation, PCR
Мультиплексирование до 384 уникально проиндексированных образцов могут быть пулированы и секвенированы вместе
Тип нуклеиновой кислоты
ДНК
Технология Секвенирование 

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
Genotyping by Sequencing
Секвенирование на:
MiniSeq System
MiSeq System
NextSeq 550 System
Анализ данных с помощью:
BaseSpace Sequence Hub
TruSeq Amplicon App