TruSight One Sequencing PanelsВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

TruSight One Sequencing Panels

Комплексные панели, предназначенные для высокочувствительных и высокоспецифичных исследований экзомных областей, ассоциированных с заболеваниями.

  • Две панели предоставляют возможность для исследований с высоким покрытием 6700 генов, ассоциированных с заболеваниями человека

  • Одна панель включает множество интересующих генов, заменяя итеративное тестирование

  • Возможность фильтрации и аннотации генов упрощают биологическую интерпретацию и составления отчётов


TruSight One Sequencing Panel охватывает >4800 генов, связанных с заболеваниями, а TruSight One Expanded Sequencing Panel  предназначена для исследования ~ 1900 дополнительных генов, которые в последних научных публикациях, также ассоциируются с заболеваниями.

Исследователи могут анализировать все гены, входящие в панель, или сосредоточиться на отдельной группе.

Спецификации

Количество стартового материала 50 нг ДНК
Описание Готовые панели, нацеленные на экзонные области, которые содержат варианты, ассоциированные с заболеваниями
Особенности содержимого TruSight One: ~12 Mb геномного содержимого (~4800 генов). 
TruSight One Expanded: ~16.5 Mb геномного содержимого (~6700 генов).
 Мультиплексирование До 96-plex
Для работы с какими платформами подходит HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, MiniSeq, MiSeq, MiSeq (в исследовательском режиме), NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000
Класс вариаций Герминальные варианты, однонуклеотидные полиморфизмы (SNP)
Тип нуклеиновой кислоты ДНК
Специализированные типы образцов Несовместимые с FFPE
Метод Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование
Для исследования каких видов подходит Человек
Технология Секвенирование

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
MiSeq 
TruSight One: 3 образца за запуск при v3 reagents (на основе 100-кратного среднего покрытия интересующего содержимого)
до 2 х 150 п.о.
NextSeq 550               TruSight One (образцов за запуск): mid output: 12, high output: 36 (на основе 100-кратного среднего покрытия интересующего содержимого)
до 2 х 150 п.о.
TruSight One Expanded: 24 образца за запуск (high output; на основе 100-кратного среднего покрытия интересующего содержимого)
до 2 х 150 п.о.
HiSeq 2500         TruSight One Expanded (образцов за запуск): rapid run: 18, high output: 95 (на основе 100-кратного среднего покрытия интересующего содержимого) до 2 х 150 п.о.
NovaSeq 6000
TruSight One Expanded: 96 образцов за запуск (S1 flow cell; на основе 100-кратного среднего покрытия интересующего содержимого)
до 2 х 150 п.о.

Сравнение наборов

       TruSight One Sequencing Panels
TruSight Inherited Disease
TruSight Cardio Sequencing Kit
Особенности содержимого
TruSight One: ~12 Mb геномного содержимого (~4800 генов). 
TruSight One Expanded: ~16.5 Mb геномного содержимого (~6700 генов).
2,25 Mb геномного содержимого (552 гена)
575 Kb геномного содержимого (174 гена)
Количество стартового материала 50 нг ДНК
50 нг ДНК
50 нг ДНК
Описание Готовые панели, нацеленные на экзонные области, которые содержат варианты, ассоциированные с заболеваниями
Готовая панель, ориентированная на изучение тяжелых педиатрических расстройств
Таргетная панель для выявления вариантов, ассоциируемых с 17 наследственными заболеваниями сердца
Мультиплексирование До 96-плекс
До 96-плекс
До 96-плекс
Для исследования каких видов подходит
Человек
Человек
Человек
Метод Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование
Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование
Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование
 Специальные типы образцов Несовместимые с FFPE
Несовместимые с FFPE
Несовместимые с FFPE

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
Секвенирование на:
HiSeq 4000 System
MiniSeq System
MiSeq System
NextSeq 550 System
NovaSeq 6000 System

Видеоссылки